null.listelement.badge
Ładowanie...
Miniatura
Licencja
ClosedAccessDostęp zamknięty
 

Opracowanie algorytmu wykorzystującego dane metagenomiczne do diagnostyki dysbioz jelita cienkiego

dc.abstract.enSmall intestinal bacterial overgrowth (SIBO) is an increasingly recognized entity, whose diagnosis in clinical practice is primarily based on the hydrogen breath test. The aim of this study was to determine whether the binary diagnosis of the disease based on the breath test is reflected in the composition and function of the duodenal microbiota. The binary diagnosis of SIBO did not differentiate the microbiota at any level of diversity, taxonomic composition, or predicted functional profile. The only consistent signal was associated with the baseline value of the breath test, and its source was allochthonous taxa. The predicted hydrogen production potential was the same in healthy and sick individuals. These results support the critical trend regarding the validity of the binary diagnosis of SIBO and argue for the need to move away from diagnosis based on a single quantitative result.
dc.abstract.plZespół rozrostu bakteryjnego jelita cienkiego (SIBO) jest coraz częściej rozpoznawaną jednostką, której diagnostyka opiera się w praktyce klinicznej głównie na wodorowym teście oddechowym. Celem niniejszej pracy było sprawdzenie czy binarne rozpoznanie choroby postawione na podstawie testu oddechowego znajduje odzwierciedlenie w składzie i funkcji mikrobioty dwunastnicy. Binarne rozpoznanie SIBO nie różnicowało mikrobioty na żadnym poziomie różnorodności, składu taksonomicznego, ani przewidywanego profilu funkcjonalnego. Jedyny spójny sygnał wiązał się z wartością bazową testu oddechowego, a jego źródłem były taksony allochtoniczne. Przewidywany potencjał produkcji wodoru był taki sam u osób zdrowych jak i chorych. Wyniki te wspierają nurt krytyczny wobec zasadności binarnej diagnostyki SIBO i przemawia za potrzebą odejścia od diagnostyki opartej na pojedynczym wyniku ilościowym.
dc.affiliationUniwersytet Warszawski
dc.affiliation.departmentWydział Matematyki, Informatyki i Mechaniki
dc.contributor.authorStanowski, Michał
dc.contributor.promoterDziewit, Łukasz
dc.contributor.reviewerDziewit, Łukasz
dc.contributor.reviewerKuźniewska, Bożena
dc.date.defence2026-07-20
dc.date.issued2026
dc.date.submitted2026-07-14
dc.identifier.apd246145
dc.languagepl
dc.language.otheren
dc.publisherUniwersytet Warszawski
dc.rightsClosedAccess
dc.subject.enmicrobiome
dc.subject.enmetagenomics
dc.subject.engastroenterology
dc.subject.enintestinal dysbiosis
dc.subject.enSIBO
dc.subject.enIMO
dc.subject.enISO
dc.subject.enSIFO
dc.subject.plmikrobiom
dc.subject.plmetagenomika
dc.subject.plgastrologia
dc.subject.pldysbiozy jelitowe
dc.subject.plSIBO
dc.subject.plIMO
dc.subject.plISO
dc.subject.plSIFO
dc.titleOpracowanie algorytmu wykorzystującego dane metagenomiczne do diagnostyki dysbioz jelita cienkiego
dc.title.alternativeDevelopment of an algorithm using metagenomic data for the diagnosis of small intestine dysbiosis
dc.typeMasterThesis